Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VwceQ3U515 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VwceQ3U515 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VwceQ3U515 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VwceQ3U515 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VwceQ3U515 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VwceQ3U515 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VwceQ3U515 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VwceQ3U515 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VwceQ3U515 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VwceQ3U515 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VwceQ3U515 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VwceQ3U515 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VwceQ3U515 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VwceQ3U515 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VwceQ3U515 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VwceQ3U515 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VwceQ3U515 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VwceQ3U515 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
VwceQ3U515 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VwceQ3U515 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VwceQ3U515 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
VwceQ3U515 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VwceQ3U515 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VwceQ3U515 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VwceQ3U515 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VwceQ3U515 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VwceQ3U515 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VwceQ3U515 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VwceQ3U515 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VwceQ3U515 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VwceQ3U515 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VwceQ3U515 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VwceQ3U515 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VwceQ3U515 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VwceQ3U515 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VwceQ3U515 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VwceQ3U515 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VwceQ3U515 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VwceQ3U515 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VwceQ3U515 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VwceQ3U515 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VwceQ3U515 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VwceQ3U515 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VwceQ3U515 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VwceQ3U515 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms