Protein–RNA interactions for Protein: Q3U410

Klhl21, Kelch-like protein 21, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl21Q3U410 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl21Q3U410 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms