Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ccndbp1Q3TVC7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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