Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ccdc136Q3TVA9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ccdc136Q3TVA9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ccdc136Q3TVA9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ccdc136Q3TVA9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ccdc136Q3TVA9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ccdc136Q3TVA9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ccdc136Q3TVA9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ccdc136Q3TVA9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ccdc136Q3TVA9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ccdc136Q3TVA9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ccdc136Q3TVA9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ccdc136Q3TVA9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ccdc136Q3TVA9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ccdc136Q3TVA9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ccdc136Q3TVA9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ccdc136Q3TVA9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ccdc136Q3TVA9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ccdc136Q3TVA9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ccdc136Q3TVA9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ccdc136Q3TVA9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ccdc136Q3TVA9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ccdc136Q3TVA9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ccdc136Q3TVA9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Ccdc136Q3TVA9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Ccdc136Q3TVA9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.4 ms