Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Calr4Q3TQS0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Calr4Q3TQS0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms