Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctdnep1Q3TP92 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms