Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms