Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp4cQ3TKR3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms