Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde12Q3TIU4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms