Protein–RNA interactions for Protein: Q32NY4

Cnnm3, Metal transporter CNNM3, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm3Q32NY4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnnm3Q32NY4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnnm3Q32NY4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnnm3Q32NY4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnnm3Q32NY4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnnm3Q32NY4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnnm3Q32NY4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnnm3Q32NY4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnnm3Q32NY4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnnm3Q32NY4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnnm3Q32NY4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnnm3Q32NY4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnnm3Q32NY4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnnm3Q32NY4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnnm3Q32NY4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnnm3Q32NY4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnnm3Q32NY4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnnm3Q32NY4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnnm3Q32NY4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnnm3Q32NY4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnnm3Q32NY4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnnm3Q32NY4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnnm3Q32NY4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnnm3Q32NY4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnnm3Q32NY4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnnm3Q32NY4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnnm3Q32NY4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnnm3Q32NY4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnnm3Q32NY4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnnm3Q32NY4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnnm3Q32NY4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnnm3Q32NY4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnnm3Q32NY4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnnm3Q32NY4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnnm3Q32NY4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnnm3Q32NY4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnnm3Q32NY4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnnm3Q32NY4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnnm3Q32NY4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnnm3Q32NY4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnnm3Q32NY4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnnm3Q32NY4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnnm3Q32NY4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnnm3Q32NY4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnnm3Q32NY4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnnm3Q32NY4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnnm3Q32NY4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnnm3Q32NY4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnnm3Q32NY4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnnm3Q32NY4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnnm3Q32NY4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms