Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M3Q31093 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M3Q31093 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms