Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp8Q2V6D6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gbp8Q2V6D6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp8Q2V6D6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms