Protein–RNA interactions for Protein: Q2PFD7

Psd3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psd3Q2PFD7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psd3Q2PFD7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psd3Q2PFD7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Psd3Q2PFD7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Psd3Q2PFD7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Psd3Q2PFD7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psd3Q2PFD7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psd3Q2PFD7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psd3Q2PFD7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psd3Q2PFD7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psd3Q2PFD7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psd3Q2PFD7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms