Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vax1Q2NKI2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms