Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDF8

Rhox4f, MCG113261, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4fQ2MDF8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox4fQ2MDF8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox4fQ2MDF8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox4fQ2MDF8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox4fQ2MDF8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox4fQ2MDF8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox4fQ2MDF8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox4fQ2MDF8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox4fQ2MDF8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox4fQ2MDF8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox4fQ2MDF8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox4fQ2MDF8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox4fQ2MDF8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox4fQ2MDF8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox4fQ2MDF8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox4fQ2MDF8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox4fQ2MDF8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rhox4fQ2MDF8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rhox4fQ2MDF8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Rhox4fQ2MDF8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rhox4fQ2MDF8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms