Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp1aQ2LKU9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nlrp1aQ2LKU9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nlrp1aQ2LKU9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nlrp1aQ2LKU9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp1aQ2LKU9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp1aQ2LKU9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp1aQ2LKU9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp1aQ2LKU9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp1aQ2LKU9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp1aQ2LKU9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp1aQ2LKU9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp1aQ2LKU9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp1aQ2LKU9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp1aQ2LKU9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms