Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cpne9Q1RLL3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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