Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fam171bQ14CH0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam171bQ14CH0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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