Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf3ip1Q149C2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf3ip1Q149C2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf3ip1Q149C2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf3ip1Q149C2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf3ip1Q149C2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf3ip1Q149C2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms