Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
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Spatc1Q148B6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms