Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc39dQ0VF76 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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