Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap5bQ0V8T8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms