Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SobpQ0P5V2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms