Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q08AU9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q08AU9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q08AU9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q08AU9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q08AU9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q08AU9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q08AU9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q08AU9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q08AU9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q08AU9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q08AU9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q08AU9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q08AU9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q08AU9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q08AU9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q08AU9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q08AU9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q08AU9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q08AU9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q08AU9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q08AU9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q08AU9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q08AU9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q08AU9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q08AU9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q08AU9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q08AU9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q08AU9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q08AU9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q08AU9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q08AU9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q08AU9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q08AU9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q08AU9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q08AU9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q08AU9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q08AU9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q08AU9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q08AU9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q08AU9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q08AU9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q08AU9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q08AU9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q08AU9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q08AU9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q08AU9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q08AU9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q08AU9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q08AU9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q08AU9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q08AU9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q08AU9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q08AU9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q08AU9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q08AU9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q08AU9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q08AU9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q08AU9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q08AU9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q08AU9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q08AU9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q08AU9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q08AU9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q08AU9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q08AU9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q08AU9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q08AU9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q08AU9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q08AU9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q08AU9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q08AU9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q08AU9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q08AU9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q08AU9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q08AU9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q08AU9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q08AU9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q08AU9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q08AU9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q08AU9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q08AU9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q08AU9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q08AU9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q08AU9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q08AU9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q08AU9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q08AU9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q08AU9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q08AU9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q08AU9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q08AU9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q08AU9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q08AU9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q08AU9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q08AU9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q08AU9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q08AU9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q08AU9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q08AU9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms