Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssrp1Q08943 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms