Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Fmn1Q05860 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Fmn1Q05860 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Fmn1Q05860 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Fmn1Q05860 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Fmn1Q05860 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Fmn1Q05860 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Fmn1Q05860 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Fmn1Q05860 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Fmn1Q05860 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Fmn1Q05860 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Fmn1Q05860 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Fmn1Q05860 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Fmn1Q05860 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Fmn1Q05860 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Fmn1Q05860 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Fmn1Q05860 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Fmn1Q05860 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Fmn1Q05860 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Fmn1Q05860 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Fmn1Q05860 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Fmn1Q05860 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Fmn1Q05860 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Fmn1Q05860 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Fmn1Q05860 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Fmn1Q05860 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Fmn1Q05860 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Fmn1Q05860 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Fmn1Q05860 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Fmn1Q05860 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Fmn1Q05860 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Fmn1Q05860 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Fmn1Q05860 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Fmn1Q05860 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Fmn1Q05860 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Fmn1Q05860 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Fmn1Q05860 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Fmn1Q05860 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Fmn1Q05860 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Fmn1Q05860 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Fmn1Q05860 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Fmn1Q05860 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Fmn1Q05860 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Fmn1Q05860 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Fmn1Q05860 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Fmn1Q05860 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Fmn1Q05860 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Fmn1Q05860 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Fmn1Q05860 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Fmn1Q05860 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Fmn1Q05860 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Fmn1Q05860 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Fmn1Q05860 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Fmn1Q05860 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Fmn1Q05860 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Fmn1Q05860 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Fmn1Q05860 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Fmn1Q05860 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Fmn1Q05860 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms