Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rcn1Q05186 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rcn1Q05186 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rcn1Q05186 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms