Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apoc2Q05020 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms