Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RelbQ04863 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RelbQ04863 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RelbQ04863 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RelbQ04863 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RelbQ04863 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RelbQ04863 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RelbQ04863 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms