Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Emx2Q04744 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Emx2Q04744 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms