Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr1fQ02284 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr1fQ02284 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms