Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnnb1Q02248 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctnnb1Q02248 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctnnb1Q02248 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnb1Q02248 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnb1Q02248 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnb1Q02248 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnb1Q02248 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnb1Q02248 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnb1Q02248 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnb1Q02248 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnb1Q02248 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnb1Q02248 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnb1Q02248 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnb1Q02248 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnb1Q02248 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnb1Q02248 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnb1Q02248 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnb1Q02248 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnb1Q02248 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnb1Q02248 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnb1Q02248 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnb1Q02248 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnb1Q02248 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnb1Q02248 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnb1Q02248 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnnb1Q02248 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnnb1Q02248 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnnb1Q02248 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnnb1Q02248 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnnb1Q02248 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms