Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RykQ01887 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RykQ01887 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RykQ01887 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RykQ01887 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RykQ01887 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RykQ01887 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RykQ01887 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RykQ01887 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RykQ01887 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RykQ01887 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RykQ01887 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RykQ01887 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RykQ01887 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RykQ01887 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RykQ01887 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RykQ01887 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RykQ01887 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RykQ01887 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RykQ01887 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RykQ01887 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RykQ01887 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RykQ01887 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RykQ01887 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RykQ01887 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RykQ01887 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RykQ01887 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RykQ01887 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RykQ01887 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RykQ01887 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RykQ01887 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RykQ01887 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RykQ01887 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RykQ01887 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RykQ01887 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RykQ01887 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RykQ01887 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RykQ01887 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RykQ01887 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RykQ01887 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RykQ01887 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RykQ01887 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RykQ01887 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RykQ01887 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RykQ01887 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RykQ01887 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RykQ01887 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RykQ01887 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RykQ01887 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RykQ01887 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RykQ01887 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RykQ01887 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RykQ01887 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RykQ01887 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RykQ01887 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RykQ01887 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RykQ01887 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RykQ01887 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RykQ01887 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RykQ01887 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RykQ01887 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RykQ01887 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RykQ01887 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RykQ01887 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RykQ01887 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RykQ01887 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RykQ01887 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RykQ01887 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RykQ01887 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RykQ01887 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RykQ01887 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RykQ01887 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RykQ01887 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RykQ01887 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RykQ01887 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RykQ01887 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RykQ01887 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RykQ01887 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RykQ01887 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RykQ01887 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RykQ01887 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RykQ01887 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RykQ01887 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RykQ01887 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RykQ01887 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RykQ01887 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RykQ01887 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RykQ01887 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RykQ01887 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RykQ01887 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RykQ01887 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RykQ01887 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RykQ01887 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RykQ01887 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RykQ01887 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RykQ01887 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RykQ01887 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RykQ01887 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RykQ01887 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RykQ01887 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms