Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gja5Q01231 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja5Q01231 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms