Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms