Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lama4P97927 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lama4P97927 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lama4P97927 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lama4P97927 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lama4P97927 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Lama4P97927 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lama4P97927 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lama4P97927 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Lama4P97927 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lama4P97927 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms