Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Meis3P97368 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Meis3P97368 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Meis3P97368 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Meis3P97368 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Meis3P97368 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Meis3P97368 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Meis3P97368 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Meis3P97368 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms