Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubg1P83887 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 503.8 ms