Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms