Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otx2P80206 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otx2P80206 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otx2P80206 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otx2P80206 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otx2P80206 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms