Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Polr1bP70700 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms