Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fgf11P70378 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fgf11P70378 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fgf11P70378 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fgf11P70378 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fgf11P70378 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms