Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tgif1P70284 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgif1P70284 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms