Protein–RNA interactions for Protein: P70275

Sema3e, Semaphorin-3E, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3eP70275 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema3eP70275 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms