Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad54lP70270 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad54lP70270 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad54lP70270 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad54lP70270 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad54lP70270 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad54lP70270 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad54lP70270 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad54lP70270 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rad54lP70270 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rad54lP70270 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad54lP70270 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad54lP70270 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad54lP70270 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad54lP70270 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad54lP70270 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad54lP70270 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad54lP70270 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad54lP70270 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad54lP70270 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad54lP70270 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad54lP70270 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad54lP70270 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad54lP70270 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad54lP70270 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad54lP70270 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad54lP70270 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad54lP70270 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad54lP70270 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rad54lP70270 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad54lP70270 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad54lP70270 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad54lP70270 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rad54lP70270 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad54lP70270 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad54lP70270 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rad54lP70270 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rad54lP70270 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad54lP70270 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rad54lP70270 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad54lP70270 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad54lP70270 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rad54lP70270 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad54lP70270 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad54lP70270 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad54lP70270 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad54lP70270 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad54lP70270 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad54lP70270 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad54lP70270 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad54lP70270 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad54lP70270 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad54lP70270 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad54lP70270 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad54lP70270 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad54lP70270 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad54lP70270 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad54lP70270 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rad54lP70270 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rad54lP70270 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad54lP70270 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad54lP70270 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad54lP70270 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad54lP70270 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad54lP70270 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad54lP70270 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad54lP70270 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rad54lP70270 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rad54lP70270 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad54lP70270 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad54lP70270 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms