Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SbdsP70122 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SbdsP70122 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SbdsP70122 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SbdsP70122 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SbdsP70122 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SbdsP70122 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SbdsP70122 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SbdsP70122 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SbdsP70122 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SbdsP70122 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SbdsP70122 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SbdsP70122 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms