Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crip1P63254 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Crip1P63254 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crip1P63254 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crip1P63254 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crip1P63254 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crip1P63254 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crip1P63254 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crip1P63254 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crip1P63254 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crip1P63254 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crip1P63254 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crip1P63254 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crip1P63254 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crip1P63254 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crip1P63254 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crip1P63254 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crip1P63254 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crip1P63254 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crip1P63254 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crip1P63254 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crip1P63254 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crip1P63254 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crip1P63254 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crip1P63254 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms