Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rps27aP62983 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps27aP62983 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms