Protein–RNA interactions for Protein: P62956

Cacng7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng7P62956 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng7P62956 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng7P62956 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng7P62956 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng7P62956 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng7P62956 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng7P62956 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng7P62956 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng7P62956 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng7P62956 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng7P62956 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng7P62956 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng7P62956 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng7P62956 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng7P62956 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng7P62956 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng7P62956 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng7P62956 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng7P62956 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng7P62956 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng7P62956 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng7P62956 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacng7P62956 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cacng7P62956 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng7P62956 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng7P62956 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng7P62956 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng7P62956 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng7P62956 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng7P62956 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng7P62956 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng7P62956 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng7P62956 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng7P62956 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng7P62956 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng7P62956 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng7P62956 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng7P62956 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng7P62956 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng7P62956 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng7P62956 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng7P62956 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng7P62956 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng7P62956 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng7P62956 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng7P62956 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng7P62956 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng7P62956 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng7P62956 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng7P62956 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng7P62956 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng7P62956 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng7P62956 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng7P62956 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng7P62956 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cacng7P62956 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng7P62956 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng7P62956 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cacng7P62956 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cacng7P62956 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms