Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps3P62908 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps3P62908 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps3P62908 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps3P62908 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps3P62908 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps3P62908 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms